Была такого рода оказия! Похоже суть косяка в том, что к старым конфигам прибавляются новые, вместо того, чтобы их заменять, и получается каша. Рецепт лечения у меня заключался в следующем:
Брал рекавери утилиту, путём подмены файлов, тех что есть в утилите, на те что сбэкапил перед прошивкой, перезаливал старую прошивку. Сбрасывал настройки на заводские (долгим удержанием ресета). Потом, если версия новой прошивки имеет слишком большую разницу с той, что была на момент перешивки, то качал отсюда версию на ступеньку больше чем была изначально прошита (допустим была 2.04 качал 2.05, а не сразу 2.08). Конфиги вроде бы корректно дополнялись. Делал опять ресет к заводским. И так, до тех пор, пока нормально само не обновилось через веб.
Опять-таки, хотел написать авторам, но никак руки на доходили. Пожалуй сейчас это сделаю А чего рекавери утилита при её использовании не затирает старые конфиги? Или я не прав?