Столкнулся примерно с той же проблемой, что и r13. В моём случае правила рефрешатся стабильно каждые 30 секунд, т.е. по сути каждые 30 секунд имею потерю пакетов из-за слетающих правил.
Начал копать, включил self-test и по нему увидел, что каждые 30 секунд происходит какая-то история с IPv6. Выглядит это так:
[I] May 6 19:32:52 ndm: Network::NeighbourTable: -> IPv6 (1): [fe80::cdd:967f:4ac4:32c7] - expired (LastSeen: 3).
[I] May 6 19:32:52 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 16, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:32:52 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 8, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:32:52 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 9, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:32:52 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 11, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:32:52 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 19, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:32:52 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 12, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:32:52 ndm: Netfilter::Util::Conntrack: flushed 3 unreplied IPv4 connections.
[I] May 6 19:32:52 root: Updating mark step 1 result: 0
...
[I] May 6 19:33:22 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 16, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:33:22 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 8, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:33:22 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 9, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:33:22 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 11, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:33:22 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 19, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:33:22 ndm: Network::NeighbourTable: neighbour event: ID: 12, address: ipv6, action: new.
[I] May 6 19:33:23 ndm: Netfilter::Util::Conntrack: flushed 4 unreplied IPv4 connections.
[I] May 6 19:33:23 ipsec: 13[CFG] statistics was written
[I] May 6 19:33:23 root: Updating mark step 1 result: 0
Последняя строка - лог из моего скрипта, лежащего в netfilter.d.
Отключил IPv6 на уровне компонентов (провайдер всё-равно пока не поддерживает), всё стало тихо и спокойно.
Товарищи разработчики, исправьте, пожалуйста, это поведение. Хочется иметь включённый IPv6 без постоянного 30 секундного сброса правил в iptables.