В принципе, на сертификатах LE можно сделать IKEv2. Но проблема тут довольно глубокая и фундаментальная.
Когда у тебя устройства подконтрольны и свой CA, то можно выписать цепочку сертификатов так, чтобы не было IKE-фрагментации.
А с LE, пока у них нет ECDSA-корня, длинная цепочка с intermediate и пока приходится выписывать клиентские RSA минимум по 2048 бит, то IKE-сообщения с fullchain будут фрагментированны.
Многие клиенты этих шуток (хотя они и есть в спецификации) не понимают, и мы получаем болт.
Потому на самом деле единственное тут чего мы все ждем - это ECDSA-корня у Let's Encrypt. Обещают уже несколько лет подряд.