Была аналогичная проблема, пропал гигабит на порту WAN. Подключал WAN порт коротким проверенным заводским патчкордом к гигабитному свитчу - та же история, 100 МБит. Решил следующим образом:
в настройках скорости порта выставил 10 МБит, сохранил, затем 100 МБит дуплекс автосогласование, затем 100 МБит полудуплекс автосогласование, затем 1000 МБит дуплекс автосогласование, затем обратно "Авто". Ну или примерно так. В общем попереключал режимы.
И после этих манипуляций роутер снова сам начал подключаться на 1000, в том числе к провайдерской линии напрямую.
Как говорится, будем посмотреть. Похоже, проблема с прошивкой всё-таки.